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科学网微生信MCP:智imToken能体agent可调用的科研绘图

发布时间:2026/10/30 点击量:

以「微生信」在知网检索中文科技类文献约 1.08 万篇 ,注册用户 41+ 万 ,。

params={}),imToken钱包下载,等待后用 同一个 request_id 重试,per_call_points = 0),需使用站点会员 Key。

微生信MCP:智能体agent可调用的科研绘图

6. 数据与隐私 仅接收用户主动提交的 TSV。

数据体量 :单次 TSV 总量 ≤ 1 MiB, get_module_schema(module_id=plot_basic_gopathway_enrichment_bubbleplot_081) → 确认列顺序 term / enrichment / pvalue / count, 2. 平台背景(为什么值得接入) 0 代码 :粘贴数据、点几下就能出图。

避免重复任务与重复扣费, 不要重复提交 :超时先 get_result 查原编号, 对话式体验 :用户说「把这份富集结果画成气泡图。

0 代码科研绘图,引用有据可依, data_tsv=term\tenrichment\tpvalue\tcount\n...。

用户只看到成图, 免费 / 收费模块 :公共 Key 仅能运行免费模块 (free = true。

只画图、不算数据 :不执行上游富集 / 差异计算,不要重提 busy / rate_limited 队列繁忙或触发 5 秒频控。

模块可用性 :available=false 的模块仅供介绍,protocolVersion = 2025-03-26 serverInfo Weishengxin Bioinformatics Plotting / 微生信绘图。

微生信( https://www.bioinformatics.com.cn )是面向生命科学、医学与多组学研究的在线分析与可视化云平台,累计完成作图 / 分析任务 600 万次 (截至 2026-10),imToken官网下载, 调用约束(客户端应遵守) 串行排队 :全局单任务队列。

request_id=UUID,取回 png / pdf / svg / tiff 链接,包括 Cell 、 Nature Biotechnology 、 Nature Communications 等高分期刊, 未受理 等待后以同一 request_id 重试 available=false 该模块仅介绍、不可执行 换 available=true 模块 8. 上线审核信息 公共 Key(审核与体验直接用) :wsx_sk_nq-OwgdMcnOiLhuJSiE3AtnhVtG_GnKvrM9C6Z4vHuY 权限范围: 仅免费模块 (free = true),全部计算与渲染在微生信服务器完成; 客户端只传 TSV 与参数、接收结果链接,例如富集气泡图 plot_basic_gopathway_enrichment_bubbleplot_081, 4. 配置示例 配置项 必填 说明 url 是 固定 https://www.bioinformatics.com.cn/mcp Authorization 是 微生信公共 Key wsx_sk_nq-OwgdMcnOiLhuJSiE3AtnhVtG_GnKvrM9C6Z4vHuY(仅免费模块);缺失或失效时端点返回 401 {error:密钥无效或已停用} 5. 典型使用流程 list_modules(keyword=富集 气泡图) → 命中 plot_basic_gopathway_enrichment_bubbleplot_081(富集气泡图, 客户端按 schema 组装 TSV,不读取客户端本地文件、不访问用户其他数据,按 BP/CC/MF 分面」→ AI 自动完成上面 5 步,接入方请以 tools/list 的实时返回为准,version = 1.26.0 capabilities tools / resources / prompts / experimental tools/list 成功返回 list_modules、get_faq 等 6 个工具 未带 Key 访问 401 {error:密钥无效或已停用}(鉴权生效) 可用性 :7×24 常驻。

draw_plot(module_id=...。

free),且只对提交该任务的 Key 可见(get_result 有结果范围隔离),接入方应在 list_modules 结果中同时检查 free 与 available。

get_result(request_id=UUID) 轮询, 服务端不额外采集客户端环境信息, 1. 基础信息 关于托管类型:本服务必须选「云端托管 / 远程服务」,返回 busy / rate_limited 表示 未受理 , 不可调用 draw_plot;以 available=true 为准。

https://blog.sciencenet.cn/blog-707141-1558835.html 上一篇:在线绘制扇形二分类混淆矩阵 ,可直接或经 Illustrator / Inkscape 调整后用于论文, 服务是常驻公网的远程端点(/mcp),可直接写入审核表单与公开文档; 健康检查 :使用上述 Key 访问 https://www.bioinformatics.com.cn/mcp,输入必须是已算好的结果表(如 metascape、clusterProfiler 输出),无需编写 R / Python 代码,不适用「仅本地可用」,引用规范见站点说明(英文版 SRplot 已发表于 PLOS ONE), 已实测通过 (2026-10-22): 检查项 结果 initialize 成功,目前提供 300+ 款 在线绘图与分析模块, 实际使用规模 :上线 6 年多。

大批量场景建议按队列依次提交并轮询。

覆盖「发现 → 查格式 → 提交 → 取结果」完整闭环;后续会 陆续扩充 新的公开工具(如更多分析类能力),SLA 与站点一致, Q:图能直接用于发表吗? 输出 PDF / SVG 为矢量格式,本 MCP Server 把这些模块开放给支持 MCP 的 AI 客户端:查模块、读数据格式、传 TSV、后台渲染、取回期刊级 png / pdf / svg / tiff 成图, 不需要安装 Python / R / conda。

一句话出图,可正常完成 initialize 与 tools/list, 9. 常见问题

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