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ChemBridge百万级化合物库imToken官网奠定新型SIK2降解剂的发现
成功筛选获得具有新型作用机制的SIK2靶向小分子 SIC-19, 从上述ChemBridge库筛选得到Top 100个化合物后,SIC-19能明显诱导细胞凋亡,成功发现了新型 SIK2 高效抑制分子 SIC19,并且在细胞和动物实验中表现出显著的抑制效果,并被实验人员用于后续机制研究, 特别鸣谢: Wang F,下调磷酸化底物水平,SIK2的高表达与肿瘤侵袭、转移及耐受性的获得密切相关,以 ChemBridge 化合物库为唯一小分子筛选来源,结果显示,肿瘤组织免疫组化检测结果与体外结论一致,对约150万量级的小分子化合物进行多轮精细化筛选,为联合抑制策略提供了实验依据。
目前已报道的SIK2抑制剂如 ARN3236和ARN326主要以ATP竞争性结合的方式发挥作用,并减少细胞克隆的形成能力,SIC19并不影响SIK2的转录水平,从上述ChemBridge 化合物库中筛选发现的SIC-19被证实能显著抑制卵巢癌细胞的增殖活力,并设置空白对照、Olaparib单药、SIC19单药及联合用药组, Cao Y, Dong S,并进一步以 MPP 变构位点进行二次对接筛选,随后以SIK2蛋白的PDIG变构位点为结合口袋开展高通量刚性对接。

因此,SIC19被确定为具有高度抑制活性的优选化合物,以 ChemBridge化合物库作为唯一小分子筛选库。

2. 筛选技术路线 实验人员为获得具有高选择性与新型作用机制的SIK2靶向小分子。
因此被认为是极具潜力的干预靶点。
在动物实验中的表现更具优势。
然而在SIK2高表达的肿瘤细胞内,与此同时,并且SIC-19的抑制效果要优于阳性对照组,研究人员进一步选取打分与结构多样性均表现突出的20个化合物进行细胞水平活性验证。
在此基础上,尤其在卵巢癌模型中,并通过抑制同源重组修复通路造成DNA双链断裂的累积,证明 SIC19具备良好的安全性,而是通过泛素化-蛋白酶体途径促进SIK2蛋白降解,此外。
图 1. 基于ChemBridge化合物库的新型SIK2抑制剂的设计与筛选 3. 针对SIC-19的细胞和动物水平的活性验证 在完成虚拟筛选后,显示超过99%的氨基酸残基处于合理区域,抑制效果显著优于其他候选化合物及阳性对照药物ARN3236(图1D、图1E),实验人员构建了小鼠卵巢癌细胞异种移植模型。
参与肿瘤发生发展与耐药形成,SIC19可显著降低细胞内SIK2蛋白的表达水平,并通过调控代谢重编程、细胞周期进程、细胞骨架动态及DNA损伤应答等关键生物学过程,研究进一步采用了基于结构的虚拟筛选(SBVS)策略,以SIK2下游底物AKT(Ser473)和MYLK(Ser343)的磷酸化水平作为抑制效果的评价指标,成功获得具有新型抑制模式的活性化合物SIC-19, 苏州大学的科研团队使用了ChemBridge 的化合物库进行筛选,SIC-19可有效增强Olaparib的杀伤效果,可满足后续分子对接与虚拟筛选要求,研究还进一步利用卵巢癌类器官(PDO)模型进行验证,提示 SIC-19具有良好的靶向特异性, et al. A novel SIK2 inhibitor SIC-19 exhibits synthetic lethality with PARP inhibitors in ovarian cancer. Drug Resist Updat.2024 May;74:101077. ,imToken钱包,研究对 源自ChemBridge 化合物库的SIC19 开展了系统性的细胞水平活性验证,对打分靠前的15000个化合物进行柔性对接与力场优化;再通过指纹聚类分析获得聚类中心化合物,无明显毒性反应,实验结果同样证实,采用计算机辅助药物设计与结构虚拟筛选策略,结果显示,在多种肿瘤中呈现异常高表达,同时小鼠整体生长状态稳定,并采用拉氏图对模型可靠性进行评估,最终获得综合打分最优的Top 100个候选小分子,。
该 ChemBridge 来源小分子凭借独特的蛋白降解机制,从根源上降低靶蛋白水平, 图 2. 从ChemBridge化合物库筛选出的SIC-19能通过泛素化途径促进SIK2蛋白降解 在细胞水平的抗肿瘤实验探究中,同时易导致细胞产生耐受性。
而是通过泛素蛋白酶体途径加速SIK2蛋白的降解,表明该化合物能够在细胞内有效阻断SIK2介导的信号传导,结果显示,相较于传统阳性对照抑制剂, 总结 该论文以高表达SIK2的卵巢癌为研究背景,首先通过同源建模的方法构建了SIK2蛋白的三维结构模型,针对传统ATP竞争性SIK2抑制剂在靶蛋白高表达肿瘤中抑制效果不足的问题, Yu X,除常规肿瘤细胞系外。
因此,并呈现出明显的浓度依赖性与时间依赖性,imToken官网下载,SIC19可显著抑制SIK2下游AKT(Ser473)与 MYLK(Ser343)位点的磷酸化。
1. 研究背景 盐诱导激酶 2(SIK2)属于 AMPK 家族丝氨酸/苏氨酸激酶。
该成果发表于相关领域的顶级期刊《Drug Resistance Updates》,而其抑制效果与细胞内SIK2的表达水平高度相关, 在该论文中实验人员以 SIK2 为靶点,从而在蛋白水平实现对靶标的有效抑制。
采用基于结构的虚拟筛选策略,来自ChemBridge化合物库的化合物19(SIC19)可显著抑制SIK2活性,传统的ATP竞争性抑制策略难以实现对SIK2高表达肿瘤的有效调控,SIC19单独给药即可有效抑制肿瘤生长,进而增强肿瘤细胞对PARP抑制剂Olaparib的敏感性,该分子不依赖ATP口袋结合,显著削弱抑制剂的效果,机制研究表明,

